Добрый день. Настоящая работа двигателя может быть и не связана с заменой клапана 5 тыс. км назад. Диагностируйте двигатель в момент проявления неисправности, т.е. на холодную. Помимо проверки топливной системы и работы форсунок, посмотрите также параметры работы системы зажигания, почитайте коды ошибок, нет ли пропусков по цилиндрам, корректны ли показания датчиков температуры, воздуха.
Mazda 3