Здравствуйте, если проблема началась после замены сцепления, то проблему ищите там, возможно перескочил в пазах синхрон и сейчас получается в зацепе какая-то скорость или вилка, которая придвигает передачу к первичному валу открутилась от штока, на котором она сидит и передача осталась включённой. Понятно будет после снятие и разборки. Еще мог развалиться подшипник первичного вала.
Балаково, LADA (ВАЗ) 2108