Здравствуйте.
Нет, вентилятор не влияет на акпп. А двигатель перегревается? При нагреве может например пропадать контакт провода акпп. Нужно решить вопрос с вентилятором (проверить предохранитель, реле, проводку и разъемы, сам вентилятор, датчик температуры ОЖ). Так же проведите диагностику сканером и проверьте параметры работы датчиков и соленоидов акпп.
Балаково, Kia Ceed