Добрый день.
Каков пробег автомобиля?
Катушки менялись местами от рабочих цилиндров, то есть от второго и четвертого?
Форсунки проверить не помешает, также как и компрессию в цилиндрах.
Если эти все манипуляции будут проводиться по гарантии, тогда можно на них и пойти, только прежде чем это делать, нужно предварительно проверить форсунки, катушки, проводку, сигналы от ЭБУ на эти форсунки и т.д.
Также, Вам будет интересна статья их Базы знаний:
https://blamper.ru/auto/wiki/dvigatel/troit-dvigatel-116495
Херсон, Skoda Octavia