Добрый день, уважаемый автовладелец!
Если при демонтаже интеркуллера этот свист пропадал - то логично предположить, что проблема в нем.
Но если этого точно не определить, тогда уже подключать дымогенертор, и смотреть где есть утечка. Иных более менее адекватных способов нет, если только не говорить об заменах методом исключения, что не всегда целесообразно по стоимости и затратах времени.
Херсон, Skoda Octavia