Добрый вечер!
Если сигнализация не реагирует на брелок, попытки перезаписи тоже не дают результатов, то не исключено что она неисправна.
Второй брелок присутствует, его тоже не записывает система?
Обратитесь к установщикам, пусть проверят проводку, правильность подключения, и уже по результату будет понятно что с сигнализацией.
Херсон, Skoda Octavia