Под клапанной крышкой больше всего подвижных деталей, способных издавать стук. Например клапан во втулке, компенсатор может стучать от нарушенной геометрии посадочных мест или проблем с подводом масла, фазовращатели могут стучать, валы в постелях... Вам придётся слушать внимательнее и менять режимы работы для провокации стука и его изменения. Мы ничем помочь не сможем, такие вопросы решаются только непосредственно на автомобиле.