Ну раз вы уже все поменяли, то теперь остается замерить компрессию и проверить управляющие сигналы в проводке на форсунки/катушки 1го и 3го цилиндров. В одной из этих цепей точно не будет сигнала - так что нужно будет осматривать эти части проводки на предмет разрывов или потерь контактов в разъемах , что найдете - устранить. Если в проводке нет проблем, то высока вероятность, что погорели мозги - заменить.
Москва, Ford Focus ST