Добрый день, уважаемый автовладелец!
В первую очередь, смените масло в АКПП, так как при его износе могут наблюдаться толчки при переключении передач.
Как правило, это помогает.
Если ничего не изменится, тогда уже подключать сканер, смотреть работу электроники. Далее - или мириться или ремонтировать.
Херсон, Skoda Octavia