Здравствуйте, проверьте, надежно ли закреплена панель приборов, отопитель и состояние подвески. Глухой стук вполне может исходить от деталей подвески. Еще могут петли на капоте стучать, попробуйте подложить резинки. Также под капотом в районе салонного фильтра стоит заслонка, крепится на защелки, при езде на плохой дороге капот двигает её, и она может издавать шум.
Балаково, LADA (ВАЗ) 2108