Здравствуйте, с большой долей вероятности дело в подшипнике первичного вала - надо разбирать коробку, проверять, при необходимости менять подшипник. Я бы рекомендовал с этой целью посетить СТО
Симферополь, Kia Rio
Помимо подшипника первичного вала проблема может быть в сцеплении - в любом случае надо снимать КПП