Здравствуйте!
Расположение выводов модуля зажигания это просто конструктивные особенности. Залитые в эпоксидке пузыри воздуха тоже не страшно. Стартер может не включаться при неисправности замка зажигания или реле (если есть).
Кроме системы зажигания (свечи и провода меняли?) могут быть "виноваты" неотрегулированные клапаны, неисправные или засоренные форсунки и низкое давление в рампе (как вариант пониженное давление и производительность насоса).
Проверяйте указанные детали и меняйте неисправные.
Мытищи, LADA (ВАЗ) 2120