Сложно однозначно утверждать. Конечно некоторая разница и должна быть, всё таки накоротка общее сопротивление цепи ниже, чем как всё подсоеденено на машине. А насколько критично, подскажет тестер и замеры в разных точках. Напрашивается совет-зачистить все контакты, проверить, нет ли следов перегрева на клеммах контактной группы замка, на проводах стартера.