Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Дверь багажника открывается с салона, или с кнопки на двери?
В таком случае, проверяйте кнопку на пульте, ее работоспособность.
Если есть второй ключ, пробуйте открывать ним.
В случае если дверь не открывается вовсе, тогда проверять предохранитель в салонном блоке, после сбрасывать клеммы с АКБ, для перезагрузки системы, и уже далее на диагностику.
Херсон, Skoda Octavia