Здравствуйте, причина может быть в износе синхронизатора 2-й передачи, нужно разбирать коробку и проводить дефектовку. Еще замерьте компрессию, возможно у Вас проблемы с поршневой, также стоит проверить давление в рампе, чтобы проверить работу бензонасоса. Если не поможет, то потребуется комплексная диагностика с чтением ошибок сканером.
Балаково, LADA (ВАЗ) 2108