Здравствуйте, причина может быть в износе сцепления, поэтому и хрустит под капотом, нужно проверять состояние вилки, выжимного подшипника, диска, корзины, еще может быть изношен синхронизатора 4-й передачи, если выбивает передачу и хрустит коробки, то нужно разбирать коробку и дефектововать. Также стоит проверить уровень масла в МКПП. По поводу двигателя - это другая тема, задайте по ней новый вопрос.
Балаково, LADA (ВАЗ) 2108