Добрый вечер. Да, это скорее всего и есть от дождей. Возможно всё-же где-то черпанули небольшую лужу и немного попало в воздухозаборник. После периода сильных ливневых дождей воздушный фильтр стоит проверять. И если как в Вашем случае, имеет место наличие влаги и песка, то фильтр лучше заменить. Треснутый корпус также лучше купить новый, или как-то попытаться запаять этот. В общем ничего страшного нет, меняйте воздушный фильтр и аккуратней в сильные дожди.
Mazda 3