Здравствуйте!
Второй вентилятор включается при перегреве двигателя, если один "не справляется". Раздельное управление организовано на уровне программы и для изменения алгоритма их работы надо перепрограммировать контроллер двигателя. Вообще я не советую делать одновременное включение двух вентиляторов. У меня настроены первый 87-92, второй 94-99.
Мытищи, LADA (ВАЗ) 2120