Здравствуйте, Вы проверили практически все возможное, однако, если происходят хлопки в глушителе - это позднее зажигание. Попробуйте еще трамблер покрутить. Еще лучше - если со стробоскопом. Все это при условии, что ремень ГРМ установлен правильно по меткам и не перескочил на пару зубьев. Кроме того, проверьте состояние воздушного фильтра и дроссельного узла, не загрязнены ли заслонки.
Балаково, LADA (ВАЗ) 2108