В МКПП скорее всего заклинил(и) подшипник(и) первичного вала. Скрежет возникает из-за того, что внешняя обойма подшипника проворачивается в посадочном месте. Рекомендую снять МКПП и отремонтировать.
Чем быстрее поставите машину в ремонт и меньше с такой проблемой будете авто эксплуатировать, тем дешевле будет ремонт.
Чтобы минимизировать износ посадочных мест, если пока есть необходимость на машине ехать( до места ремонта, но лучше на буксире\эвакуаторе), заалейте сверх уровня около 700 мл. Таким образом подшипники первичного вала будут целиком в масле, что улучшит смазку и охлаждение.
Санкт-Петербург, Hyundai Getz