Добрый вечер.
Мое мнение - однозначно менять масло, так как при сборке коробки проследить за чистотой рабочего места довольно сложно, и после подгонки деталей при работе, в любом случае возникает притирка фрикционных поверхностей, которые сопровождаются выбросом в масло продуктов износа.
Как правило, эта 1000 км пробега выступает в роли обкатки, и после чего нужно дать АКПП возможность работать в штатном режиме, на новом масле.
Если Вас не устраивает стоимость замены в Вашем центре, и это не является обязательной нормой, то можете воспользоваться услугами ребят из списка автосервисов города Москва:
https://blamper.ru/auto/autoservices/moscow/
Херсон, Skoda Octavia