Добрый день!
На такие детали как тормозные колодки, диски, амортизаторы, многие элементы ходовой части, гарантия не распространяется - это считается расходным материалом, тем более, что прошло столько времени, можете попробовать обратиться к дилер с такой проблемой, но уверенности в ответе нет.
Диски скорее всего повело от въезда в лужу, при разогретых дисках.
В Вашем случае, Вы можете пробовать проточить диски, если позволяет их толщина, вибрация уйдет.
Херсон, Skoda Octavia