Здравствуйте.
Как отметил Дмитрий, вероятнее всего проблем связана с установкой двигателя. Нужно проверить включается ли компрессор, вентилятор, если нет, то искать проблемы в проводке, возможно что некоторые разъемы на новом двигателе отличаются и что то подсоединили неправильно. Оценить наличие фреона самостоятельно невозможно, для этого требуется специальный манометр. Количество необходимого фреона определяется по массе, под капотом должна быть табличка с необходимыми данными. Возможно что кондиционер не работает как раз из за недостаточного количества фреона в системе. Для проверки лучше обратиться в специализированный сервис по ремонту климатических систем.
Москва, Audi A5