Вы описываете два различных по природе явления: стук в кпп это незначительный люфт в подшипниках коробки, чаще всего подшипник первичного вала, а шеркание это вполне допустимый звук сцепления, когда ведущий диск неполностью отошел от маховика, и ведомый диск слегка касается контактных поверхностей. Обычно этот звук пропадает по мере приработки нового сцепления. Правда, сами понимаете, этот звук нам не слышен, и можно ошибиться, ведь при нажатии на сцепление также может издавать звуки и выжимной подшипник. Но он скорее гудит или скрежещет, если повреждён. А со стуком подшипников кпп, если он не будет прогрессировать и не перерастёт в гул, можно ездить неограниченно долго.