Здравствуйте, скорее всего посторонний шум из КПП не связан с регулировкой зажигания. Какой характер звука? Появляется во время движения или на нейтральной передачи на оборотах тоже есть? Звук пропадает при выжатом сцеплении,усиливается или меняет свой характер? Возможно вы не правильно выставили зажигание и под нагрузкой двигатель детонирует, а резонанс колебаний ошибочно указывает на звук со стороны КПП. Проверьте не задеты ли случайно какие либо шланги или жгуты проводки которые могли отцепится от штатных мест крепления и теперь задевают за какие либо подвижные части.
Красноярск, Nissan Gloria