Что делать, если багажник не открывается электронным способом в Volkswagen Jetta 6?

Здравствуйте, а АКБ у Вас не севшая, двигатель заводится нормально? Проверьте еще клеммы аккумулятора, возможно окислились, попробуйте их почистить и плотнее насадить на выводы.

Опишите подробнее, как именно Вы его открываете? Раньше работал нормально, открывался с кнопки? Возможно делаете что-то не так?
Вот несколько моментов на эту тему:
1. если нажать клавишу открывания на брелке один раз — открывается водительская дверь, два раза — все двери, включая багажник
2. для разблокировки багажника надо нажать и удерживать кнопку на брелке
3. если нажать и удерживать кнопку открывания на брелке — опустятся все стекла. и наоборот, удерживая кнопку закрывания все стекла закроются.
4. если все двери разблокированы, то при движение автоматически блокируется багажник. При остановке он разблокируется при открытии водительской двери
5. если открыть багажник кнопкой "багажник" на брелке, открыть и закрыть 5-ю дверь (механически), то заблокируется автоматически не только багажник, но и все открытые двери.

Думаю, что проблема в концевике багажника, глюкнул датчик (концевик) открытия багажника, "мозги" думают, что он открыт и не подают напряжение на активатор, концевик находится в самом замке, еще может быть активатор не рабочий, для проверки еще посмотреть есть питание на фишке активатора, но лучше всего в первую очередь просканировать диагностическим сканером на наличие ошибки, по коду сразу выявиться причина