Здравствуйте, вообще для Yaris характерен такой вой, данное авто очень плохо защищено от шума шин. А на большой скорости, к ним еще добавляется вой мотора и ветра. Все вместе это превращается в неприятный гул. Я бы еще порекомендовал бы проверить и возможно поменять ступичные подшипники. Что касается коробки, то тут могут "умирать" фрикционы, для более точного определения диагноза нужна компьютерная диагностика для поиска ошибок.
Балаково, LADA (ВАЗ) 2108