Добрый день, уважаемый автовладелец!
Проблем может быть несколько, начиная с неправильной работы заслонок отопителя, когда они неверно распределяют потоки воздуха, слабо прогретый мотор или забитый радиатор печки.
Начните с замены фильтра салона, далее проверка работы заслонок.
Плюс ко всему, из-за длины воздуховодов к задним сидениям, воздух по пути в любом случае будет охлаждаться.
Херсон, Skoda Octavia