Добрый день, уважаемый автовладелец!
То есть при включении музыки через AUX через некоторое время он отключается и играет радио? 
На автомобиле установлено штатное ГУ? 
В таком случае, похоже на какой-то программный сбой, который отключает AUX, и воспроизводит радио, такого быть не должно.
Сбрасывайте клеммы с АКБ, бля перезагрузки бортового оборудования, после уже на проверку работоспособности системы.
                                    
                                                    Херсон,                                                                            Skoda                            Octavia