Добрый день!
Причина этому может быть как сама коробка передач, двигатель при его неравномерной работе, так и опоры двигателя и МКПП.
Как работает мотор автомобиля? Ровно без каких либо отклонений, как включаются передачи?
Если с двигателем и КПП все в норме, сразу осматривайте подушки, после полуоси.
Херсон, Skoda Octavia