Здравствуйте. Очень сложно дистанционно судить о возникновении шума, при описанных Вами условиях.
Если хруст возникает на определенной передаче, то можно предположить, что проблема с КПП, или приводными механизмами.
Для диагностики желательно обратиться в сервисный центр, где авто можно будет вывесить на подъемнике, повторить возникший шум, и с помощью фонендоскопа прослушать все узлы, и сделать выводы о предстоящем обслуживании.
И желательно с этим не затягивать.
Херсон, Skoda Octavia