Как вариант, есть специальные пробойники под соответствующий диаметр, можно использовать их. Некоторые аккуратно вырезают маникюрными ножницами отверстие, а края обмазывают прозрачным клеем или лаком, чтобы не расходились. Также, если на задних сиденьях есть пластиковые насадки в тех местах, куда вставляются стойки, можно подсунуть чехол под них.
Кстати, в сети есть видео, где прорезают отверстия при наличии таких насадок.
http://www.youtube.com/watch?v=u8gAclPgjdMА по хорошему, не пробовали обменять чехлы? Если это оригинальные чехлы, а не универсальные китайские, то это брак производства, и отверстия там должны быть.
Mazda 3