Добрый день!
Начать с диагностики двигателя, и проверить опоры двигателя( они же подушки), и крепления радиатора, на некоторых автомобилях Skoda, есть гарантийные случаи, по которому радиатор издает вибрации, поэтому есть отзывная кампания, проверяется по VIN, лучше обратиться к дилеру, по этому вопросу.
Удачи!
Москва