Добрый день!
Ну возможно детонация двигателя, возможно звуки идут от опоры двигателя, или защиты картера.
Я рекомендую диагностику в любом сервисе, где есть прибор VAS PC, это диагностический прибор, для марки Skoda, который покажет неисправности в автомобиле.
Удачи.
Москва