Здравствуйте.
Однозначно сказать где именно искать неисправность сложно. Причинами могут быть изношенные опоры двигателя и КПП, люфты в механизме переключения, его приводе и неисправности в самой коробке передач. Если вибрация появляется именно на определенных передачах, то скорее всего неисправность связана либо непосредственно с включенной передачей, например износ подшипника шестерни или вала определенной передачи, либо с положением рычага и привода включения в этот момент. Возможно сбилась регулировка привода или износились шарниры в нем, и в определенных положениях, при включении определенных передач он получат дополнительные нагрузки, или наоборот имеет излишнюю свободу в шарнирах. Вследствие этого может появляться вибрация.
Москва, Audi A5