Здравствуйте. Если шум возникает на нейтральной передаче то это говорит о выработке в подшипниках первичного вала коробки передач.
Если дынные щелчки слышны только на нейтралке, и пропадают при прогазовке или нажатии на педаль сцепления - критического в этом ничего нет, но лучше продиагностировать авто на станции технического обслуживания, где с помощью фонендоскопа можно будет более точно установить причину и последующие действия по ремонту или устранению проблемы.
Херсон, Skoda Octavia