Добрый день!
Со временем теряют эластичность резиновые уплотнители крышки багажника, и пыль может попадать внутрь, осмотрите резинку.
Проверьте также дренажные каналы воздуха, которые отвечают за поддержание давления в салоне при закрытии дверей.
http://dl2.joxi.net/drive/2016/07/21/0005/4075/376811/11/5f761c8fad.jpg
Херсон, Skoda Octavia