Добрый день, уважаемый автовладелец!
Уточните, пожалуйста, что Вы подразумеваете под фразой "замена кондиционера"? Вы меняли какие-то его элементы?
Если Вы включаете кондиционер, то автоматически включается дополнительный вентилятор для обдува радиатора кондиционера.
В случае постоянной работы этого вентилятора, ищите КЗ в цепи, или неправильные показания датчиков управления системой.
Херсон, Skoda Octavia