Добрый день, уважаемый автовладелец!
Стучать могут как кузовные детали, неплотно подогнанные друг к другу (замок, крышка багажника о кузов, детали обшивки салона) так и резьбовые соединения, которые могли ослабиться.
Все это проверяется по месту, прослушивая салон при езде, по разным препятствиям, с открытым, закрытым багажником, разбирать салон, и методом исключения находить проблему.
Херсон, Skoda Octavia