Добрый день!
В Вашем моторе действительно предусмотрена процедура регулировки клапанов при пробеге в 100 000.
Регулировка осуществляется путем подбора толкателей требуемого размера.
Если горит "чек" двигателя, то ошибка уже зафиксирована, и должна быть в памяти.
Другое дело, если это пропуск зажигания, то система может не зафиксировать на каком цилиндре, но дать индикацию.
Свечи давно меняли, чистка дросселя, топливной системы производилась?
Херсон, Skoda Octavia