Василий, доброе утро.
Юридических оснований в отказе на участие в программе утилизации из-за снятого с учета транспорта нет, поскольку Вы все равно являетесь собственником ТС. Однако, иногда дилеры создают собственные правила, и могут первично отказать в участии, надеясь, что Вы не будете спорить. Не стоит обращать на подобное внимания - Вы имеете право на участие, это Ваше законное право, и снятие с учета никак юридически этому не препятствует.
Удачной покупки легковушки!
Москва, Kia Spectra