если ходовая в порядке, то есть мысль, что мотор может стучать об защиту или о крепления подушек (пробивает резину), это не страшно, но такое может быть, например, если эти самые подушки (опоры) двигателя сели, проверьте их и замените при необходимости.
Балаково, LADA (ВАЗ) 2108