А какие ошибки показывает диагностический сканер? Ведь нарушение в работе мотора на лицо. Должны быть и коды неисправностей. Или вы производили все ремонтные процедуры на ощупь, без диагностики и проверок? То, что вы описываете может быть вызвано как неверными показаниями датчиков, например разряжения на впуске или температурного, так и с нарушением в приводе ГРМ.