Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Если по коробке, ее электрооборудованию ошибок нет, масло сменили, но рывки остались, то больше всего это похоже на выработку во фрикционах, шестернях коробки, или падение давления, из-за проблем с гидроблоком, его износом.
Эксплуатируйте авто в штатном режиме, пока проблема не покажет себя, иных вариантов нет. Сейчас особо и ремонтировать нечего.
Херсон, Skoda Octavia