Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Если после нажатия на педаль сцепления гул пропадает, то больше всего это похоже на износ подшипников первичного вала в коробке, или шестерен 5 передачи. 
Все это можно будет понять только после разборки и дефектовки коробки. 
Предварительно не помешает проверить ступичные подшипники.
                                    
                                                    Херсон,                                                                            Skoda                            Octavia