Здравствуйте, скорее всего это просто совпадение, ремонт защиты никак не связан с работой двигателя, если только не задели при этом что-то из элементов топливной системы. А так, нужно подключать сканер и проверять параметры работы ТНВД, форсунок, свечей накала, замерить давление в рампе, попробовать поменять топливный фильтр, возможно он запарафинен сильно.
Балаково, LADA (ВАЗ) 2108