Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Уточните, пожалуйста, какие системы проверяли, на каком топливе работает мотор?
Если есть рывки/толчки, или троение мотора, то в первую очередь нужно проверять системы подачи топлива и зажигания, подключать сканер, проверять электронику, наличие ошибок, все данные по системе, сверять их с реальными.
Вы уточнили, что переключаетесь на механику, на ручное управление коробкой передач, то есть "тип троник"? В таком случае, проблемы нужно искать в коробке передач.
Херсон, Skoda Octavia