Здравствуйте,скорее всего, проблема в резиновых манжетах главного тормозного цилиндра.Из за выработки поверхности цилиндра, тормозная жидкость,начала просачиваться через манжет, и педаль потихоньку начала проваливаться. Возможно, под него что нибудь попало,когда тормозные цилиндры вталкивали внутрь суппортов,чтобы вставить новые колодки, при этом жидкость пошла назад в бачок.Попробуйте заменить в системе тормозную жидкость, и прокачать её.Если не станет лучше, то замените главный тормозной цилиндр.
Клин