Добрый день, уважаемый автовладелец!
За пуск авто отвечает основная батарея, которая находится под пассажирским сидением.
Дополнительная АКБ тоже находится под пассажирском сидением, в том же отделе где и основная батарея.
Для начала измерьте напряжение на АКБ, и после работу генератора, может по нем есть проблемы, или просто АКБ нужно подзарядить.
Херсон, Skoda Octavia