Для точного определения неисправности придётся обратиться на диагностику мерседесовским СтарДиагнозисом. И проверяйте также реакцию системы на второй ключ. Порядок работы системы доступа изменится не может, а вот ключ "потеряться" вполне способен, или есть иная неисправность, например по питанию антенн или управляющего блока.